農村生活垃圾，特別是當其中植物秸稈等有機物成分含量較高時，在用生活垃圾撕碎機預處理后，適合用生物法來進行處理。生物處理是在發酵過程中利用細菌分 解有機物質，它可以分為在通氣條 件下（好氧發酵）或無氧條件下（厭 氧發酵）進行的兩類。 生物降解過程可以在通氣條件下（好氧發酵）或無氧條件下（厭 氧發酵）進行。好氧發酵時會釋放 出很多的熱量；相反，厭氧發酵時 幾乎沒有熱量釋出，甚至對厭氧發 酵過程要從外界提供熱量，以便滿足發酵過程的良好條件。根據發酵 細菌類型的不同，發酵過程可以在 低溫（接近35℃）下進行或在較高的溫度（接近55℃）下進行。
發酵過程會產生一些生物氣體和固體殘留物：固體殘留物可用 作土壤的有機改良劑或肥料使用； 生物氣體是一種混合氣體，基本上是甲烷和二氧化碳，其構成比例可 以變化。在好氧發酵的過程中，生物氣體直接逸散到大氣之中，會增 強大氣的溫室效應。此外，逸散氣 體會發出令人討厭的氣味。因此人 們更情愿使用厭氧發酵的方式。在 這種情況下，產生的生物氣體中一部分可以作為發酵過程所必需的能 源，剩余部分可以收集起來用于其 他方面。在一個密閉環境中發酵， 溫度要比好氧發酵時高，這樣可以 殺滅發酵物中的致病菌，這樣就可 以避免致病菌在最終殘留物用作農 業肥料時的散播。
